Реализовать контур водяного теплого пола и 2 контура радиаторов с циркуляционным насосом на каждый контур можно при помощи схемы первично-вторичных колец. Такая схема при правильном расположении позволит системе отопления работать слажено и сбалансированно. Так же на каждый циркуляционный насос можно запитать комнатный термостат который будет автоматически управлять отоплением.
Загрузку бойлера лучше осуществлять самым первым контуром, что бы горячий теплоноситель сразу попадал в него не гуляя по первичному кольцу.
Следующим рекомендую расположить контур отопления второго этажа, т.к для него потребуется более горячий теплоноситель.
За ним расположится контур отопления 1 этажа.
А самым последним будет теплый пол т.к ему хватит остывшей обратки.